Protein–RNA interactions for Protein: Q8R262

Vmn1r201, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r201Q8R262 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r201Q8R262 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r201Q8R262 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r201Q8R262 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r201Q8R262 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r201Q8R262 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r201Q8R262 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r201Q8R262 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r201Q8R262 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r201Q8R262 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r201Q8R262 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r201Q8R262 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r201Q8R262 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r201Q8R262 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r201Q8R262 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r201Q8R262 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r201Q8R262 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r201Q8R262 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 331.8 ms