Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b4Q8QZY9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b4Q8QZY9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b4Q8QZY9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b4Q8QZY9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b4Q8QZY9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b4Q8QZY9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b4Q8QZY9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b4Q8QZY9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b4Q8QZY9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b4Q8QZY9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b4Q8QZY9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b4Q8QZY9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b4Q8QZY9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b4Q8QZY9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b4Q8QZY9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b4Q8QZY9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b4Q8QZY9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b4Q8QZY9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b4Q8QZY9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b4Q8QZY9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b4Q8QZY9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b4Q8QZY9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b4Q8QZY9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b4Q8QZY9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b4Q8QZY9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b4Q8QZY9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b4Q8QZY9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms