Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc12Q8K5B8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc12Q8K5B8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxc12Q8K5B8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc12Q8K5B8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc12Q8K5B8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc12Q8K5B8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms