Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ebf4Q8K4J2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ebf4Q8K4J2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ebf4Q8K4J2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ebf4Q8K4J2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ebf4Q8K4J2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ebf4Q8K4J2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ebf4Q8K4J2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ebf4Q8K4J2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ebf4Q8K4J2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ebf4Q8K4J2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ebf4Q8K4J2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf4Q8K4J2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf4Q8K4J2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf4Q8K4J2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf4Q8K4J2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf4Q8K4J2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf4Q8K4J2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf4Q8K4J2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf4Q8K4J2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf4Q8K4J2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf4Q8K4J2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf4Q8K4J2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms