Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfm1Q8K0D5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfm1Q8K0D5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gfm1Q8K0D5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gfm1Q8K0D5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfm1Q8K0D5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gfm1Q8K0D5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfm1Q8K0D5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfm1Q8K0D5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gfm1Q8K0D5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfm1Q8K0D5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfm1Q8K0D5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfm1Q8K0D5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfm1Q8K0D5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfm1Q8K0D5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfm1Q8K0D5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfm1Q8K0D5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfm1Q8K0D5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfm1Q8K0D5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfm1Q8K0D5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfm1Q8K0D5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfm1Q8K0D5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfm1Q8K0D5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfm1Q8K0D5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfm1Q8K0D5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfm1Q8K0D5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfm1Q8K0D5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gfm1Q8K0D5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms