Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rasgef1bQ8JZL7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1bQ8JZL7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1bQ8JZL7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasgef1bQ8JZL7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasgef1bQ8JZL7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasgef1bQ8JZL7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasgef1bQ8JZL7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgef1bQ8JZL7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms