Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip4Q8CI96 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip4Q8CI96 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip4Q8CI96 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip4Q8CI96 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clip4Q8CI96 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip4Q8CI96 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip4Q8CI96 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip4Q8CI96 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip4Q8CI96 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip4Q8CI96 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip4Q8CI96 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip4Q8CI96 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip4Q8CI96 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip4Q8CI96 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip4Q8CI96 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip4Q8CI96 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip4Q8CI96 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip4Q8CI96 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip4Q8CI96 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clip4Q8CI96 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip4Q8CI96 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip4Q8CI96 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip4Q8CI96 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip4Q8CI96 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip4Q8CI96 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip4Q8CI96 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip4Q8CI96 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms