Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc28bQ8CEG5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc28bQ8CEG5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc28bQ8CEG5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc28bQ8CEG5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc28bQ8CEG5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc28bQ8CEG5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc28bQ8CEG5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc28bQ8CEG5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc28bQ8CEG5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc28bQ8CEG5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc28bQ8CEG5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc28bQ8CEG5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc28bQ8CEG5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc28bQ8CEG5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc28bQ8CEG5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc28bQ8CEG5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc28bQ8CEG5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc28bQ8CEG5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc28bQ8CEG5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc28bQ8CEG5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc28bQ8CEG5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc28bQ8CEG5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc28bQ8CEG5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc28bQ8CEG5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc28bQ8CEG5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc28bQ8CEG5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc28bQ8CEG5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc28bQ8CEG5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc28bQ8CEG5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc28bQ8CEG5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc28bQ8CEG5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc28bQ8CEG5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc28bQ8CEG5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28bQ8CEG5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28bQ8CEG5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc28bQ8CEG5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc28bQ8CEG5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc28bQ8CEG5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms