Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc17Q8CE13 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc17Q8CE13 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc17Q8CE13 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc17Q8CE13 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc17Q8CE13 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc17Q8CE13 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc17Q8CE13 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc17Q8CE13 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc17Q8CE13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc17Q8CE13 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc17Q8CE13 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc17Q8CE13 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc17Q8CE13 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc17Q8CE13 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc17Q8CE13 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc17Q8CE13 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc17Q8CE13 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc17Q8CE13 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc17Q8CE13 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc17Q8CE13 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc17Q8CE13 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc17Q8CE13 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc17Q8CE13 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc17Q8CE13 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc17Q8CE13 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc17Q8CE13 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc17Q8CE13 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc17Q8CE13 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc17Q8CE13 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc17Q8CE13 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc17Q8CE13 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc17Q8CE13 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc17Q8CE13 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc17Q8CE13 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc17Q8CE13 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc17Q8CE13 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc17Q8CE13 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc17Q8CE13 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc17Q8CE13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc17Q8CE13 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc17Q8CE13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc17Q8CE13 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc17Q8CE13 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc17Q8CE13 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc17Q8CE13 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc17Q8CE13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc17Q8CE13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc17Q8CE13 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc17Q8CE13 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc17Q8CE13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc17Q8CE13 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc17Q8CE13 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc17Q8CE13 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc17Q8CE13 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms