Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nsun3Q8CCT7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nsun3Q8CCT7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nsun3Q8CCT7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nsun3Q8CCT7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsun3Q8CCT7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsun3Q8CCT7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsun3Q8CCT7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsun3Q8CCT7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsun3Q8CCT7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nsun3Q8CCT7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsun3Q8CCT7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsun3Q8CCT7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsun3Q8CCT7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsun3Q8CCT7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsun3Q8CCT7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsun3Q8CCT7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsun3Q8CCT7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsun3Q8CCT7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsun3Q8CCT7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsun3Q8CCT7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsun3Q8CCT7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsun3Q8CCT7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nsun3Q8CCT7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsun3Q8CCT7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsun3Q8CCT7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsun3Q8CCT7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsun3Q8CCT7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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