Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd4aQ8CBY1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samd4aQ8CBY1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Samd4aQ8CBY1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd4aQ8CBY1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd4aQ8CBY1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd4aQ8CBY1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samd4aQ8CBY1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samd4aQ8CBY1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Samd4aQ8CBY1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Samd4aQ8CBY1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samd4aQ8CBY1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd4aQ8CBY1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd4aQ8CBY1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd4aQ8CBY1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd4aQ8CBY1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd4aQ8CBY1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd4aQ8CBY1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd4aQ8CBY1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd4aQ8CBY1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd4aQ8CBY1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd4aQ8CBY1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Samd4aQ8CBY1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd4aQ8CBY1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd4aQ8CBY1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms