Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc15Q8C9M2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc15Q8C9M2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc15Q8C9M2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc15Q8C9M2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc15Q8C9M2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc15Q8C9M2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc15Q8C9M2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc15Q8C9M2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc15Q8C9M2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc15Q8C9M2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc15Q8C9M2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc15Q8C9M2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc15Q8C9M2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc15Q8C9M2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc15Q8C9M2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc15Q8C9M2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc15Q8C9M2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc15Q8C9M2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc15Q8C9M2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc15Q8C9M2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc15Q8C9M2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc15Q8C9M2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc15Q8C9M2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc15Q8C9M2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc15Q8C9M2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc15Q8C9M2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc15Q8C9M2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc15Q8C9M2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc15Q8C9M2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc15Q8C9M2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc15Q8C9M2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc15Q8C9M2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc15Q8C9M2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc15Q8C9M2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc15Q8C9M2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc15Q8C9M2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc15Q8C9M2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc15Q8C9M2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc15Q8C9M2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc15Q8C9M2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc15Q8C9M2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc15Q8C9M2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc15Q8C9M2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc15Q8C9M2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc15Q8C9M2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc15Q8C9M2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc15Q8C9M2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc15Q8C9M2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc15Q8C9M2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc15Q8C9M2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc15Q8C9M2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc15Q8C9M2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc15Q8C9M2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc15Q8C9M2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc15Q8C9M2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc15Q8C9M2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc15Q8C9M2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc15Q8C9M2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc15Q8C9M2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc15Q8C9M2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc15Q8C9M2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc15Q8C9M2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc15Q8C9M2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms