Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppfibp1Q8C8U0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppfibp1Q8C8U0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfibp1Q8C8U0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfibp1Q8C8U0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppfibp1Q8C8U0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppfibp1Q8C8U0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp1Q8C8U0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp1Q8C8U0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfibp1Q8C8U0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppfibp1Q8C8U0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppfibp1Q8C8U0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfibp1Q8C8U0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfibp1Q8C8U0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfibp1Q8C8U0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfibp1Q8C8U0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppfibp1Q8C8U0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppfibp1Q8C8U0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppfibp1Q8C8U0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppfibp1Q8C8U0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppfibp1Q8C8U0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppfibp1Q8C8U0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppfibp1Q8C8U0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppfibp1Q8C8U0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppfibp1Q8C8U0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppfibp1Q8C8U0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppfibp1Q8C8U0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfibp1Q8C8U0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfibp1Q8C8U0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfibp1Q8C8U0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfibp1Q8C8U0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfibp1Q8C8U0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppfibp1Q8C8U0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfibp1Q8C8U0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfibp1Q8C8U0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ppfibp1Q8C8U0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms