Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp20Q8C6M1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp20Q8C6M1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp20Q8C6M1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp20Q8C6M1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp20Q8C6M1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp20Q8C6M1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp20Q8C6M1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp20Q8C6M1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp20Q8C6M1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp20Q8C6M1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp20Q8C6M1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp20Q8C6M1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp20Q8C6M1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp20Q8C6M1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp20Q8C6M1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp20Q8C6M1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp20Q8C6M1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp20Q8C6M1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp20Q8C6M1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp20Q8C6M1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp20Q8C6M1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp20Q8C6M1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp20Q8C6M1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp20Q8C6M1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp20Q8C6M1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp20Q8C6M1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp20Q8C6M1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp20Q8C6M1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp20Q8C6M1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp20Q8C6M1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp20Q8C6M1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp20Q8C6M1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp20Q8C6M1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp20Q8C6M1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp20Q8C6M1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp20Q8C6M1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp20Q8C6M1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp20Q8C6M1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp20Q8C6M1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp20Q8C6M1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp20Q8C6M1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp20Q8C6M1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp20Q8C6M1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp20Q8C6M1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp20Q8C6M1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp20Q8C6M1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms