Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ClmnQ8C5W0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ClmnQ8C5W0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ClmnQ8C5W0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ClmnQ8C5W0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ClmnQ8C5W0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ClmnQ8C5W0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ClmnQ8C5W0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ClmnQ8C5W0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ClmnQ8C5W0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ClmnQ8C5W0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ClmnQ8C5W0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ClmnQ8C5W0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ClmnQ8C5W0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ClmnQ8C5W0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ClmnQ8C5W0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ClmnQ8C5W0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ClmnQ8C5W0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClmnQ8C5W0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClmnQ8C5W0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ClmnQ8C5W0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClmnQ8C5W0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ClmnQ8C5W0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ClmnQ8C5W0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ClmnQ8C5W0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ClmnQ8C5W0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ClmnQ8C5W0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ClmnQ8C5W0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ClmnQ8C5W0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ClmnQ8C5W0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ClmnQ8C5W0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ClmnQ8C5W0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ClmnQ8C5W0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ClmnQ8C5W0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ClmnQ8C5W0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ClmnQ8C5W0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ClmnQ8C5W0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ClmnQ8C5W0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ClmnQ8C5W0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ClmnQ8C5W0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ClmnQ8C5W0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ClmnQ8C5W0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ClmnQ8C5W0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ClmnQ8C5W0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ClmnQ8C5W0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ClmnQ8C5W0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ClmnQ8C5W0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ClmnQ8C5W0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ClmnQ8C5W0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ClmnQ8C5W0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ClmnQ8C5W0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ClmnQ8C5W0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ClmnQ8C5W0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ClmnQ8C5W0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms