Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ska3Q8C263 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ska3Q8C263 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ska3Q8C263 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ska3Q8C263 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ska3Q8C263 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ska3Q8C263 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ska3Q8C263 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ska3Q8C263 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ska3Q8C263 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ska3Q8C263 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ska3Q8C263 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ska3Q8C263 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ska3Q8C263 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ska3Q8C263 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ska3Q8C263 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ska3Q8C263 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ska3Q8C263 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ska3Q8C263 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ska3Q8C263 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ska3Q8C263 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ska3Q8C263 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ska3Q8C263 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ska3Q8C263 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ska3Q8C263 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms