Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FarsaQ8C0C7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FarsaQ8C0C7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FarsaQ8C0C7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FarsaQ8C0C7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FarsaQ8C0C7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FarsaQ8C0C7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FarsaQ8C0C7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FarsaQ8C0C7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FarsaQ8C0C7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FarsaQ8C0C7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FarsaQ8C0C7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FarsaQ8C0C7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FarsaQ8C0C7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FarsaQ8C0C7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FarsaQ8C0C7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FarsaQ8C0C7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FarsaQ8C0C7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FarsaQ8C0C7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FarsaQ8C0C7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FarsaQ8C0C7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FarsaQ8C0C7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FarsaQ8C0C7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms