Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx22Q8C084 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx22Q8C084 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx22Q8C084 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx22Q8C084 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx22Q8C084 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.6 ms