Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim35Q8C006 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim35Q8C006 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim35Q8C006 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim35Q8C006 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim35Q8C006 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim35Q8C006 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim35Q8C006 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim35Q8C006 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim35Q8C006 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim35Q8C006 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim35Q8C006 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim35Q8C006 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim35Q8C006 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim35Q8C006 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim35Q8C006 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms