Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Iffo1Q8BXL9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Iffo1Q8BXL9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Iffo1Q8BXL9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Iffo1Q8BXL9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Iffo1Q8BXL9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Iffo1Q8BXL9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Iffo1Q8BXL9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Iffo1Q8BXL9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iffo1Q8BXL9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Iffo1Q8BXL9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms