Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E330017A01RikQ8BU47 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E330017A01RikQ8BU47 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E330017A01RikQ8BU47 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E330017A01RikQ8BU47 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
E330017A01RikQ8BU47 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E330017A01RikQ8BU47 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E330017A01RikQ8BU47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E330017A01RikQ8BU47 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E330017A01RikQ8BU47 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E330017A01RikQ8BU47 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E330017A01RikQ8BU47 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E330017A01RikQ8BU47 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E330017A01RikQ8BU47 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E330017A01RikQ8BU47 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E330017A01RikQ8BU47 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E330017A01RikQ8BU47 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E330017A01RikQ8BU47 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E330017A01RikQ8BU47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms