Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PcgF3Q8BTQ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PcgF3Q8BTQ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PcgF3Q8BTQ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PcgF3Q8BTQ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PcgF3Q8BTQ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PcgF3Q8BTQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcgF3Q8BTQ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcgF3Q8BTQ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcgF3Q8BTQ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcgF3Q8BTQ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcgF3Q8BTQ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcgF3Q8BTQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcgF3Q8BTQ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcgF3Q8BTQ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PcgF3Q8BTQ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms