Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcfc2Q8BKT3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcfc2Q8BKT3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcfc2Q8BKT3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcfc2Q8BKT3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gcfc2Q8BKT3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcfc2Q8BKT3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcfc2Q8BKT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcfc2Q8BKT3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcfc2Q8BKT3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcfc2Q8BKT3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcfc2Q8BKT3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gcfc2Q8BKT3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gcfc2Q8BKT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gcfc2Q8BKT3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gcfc2Q8BKT3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcfc2Q8BKT3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Gcfc2Q8BKT3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcfc2Q8BKT3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcfc2Q8BKT3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcfc2Q8BKT3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcfc2Q8BKT3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcfc2Q8BKT3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcfc2Q8BKT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcfc2Q8BKT3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcfc2Q8BKT3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcfc2Q8BKT3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gcfc2Q8BKT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms