Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc9Q8BJN4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc9Q8BJN4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc9Q8BJN4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc9Q8BJN4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc9Q8BJN4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc9Q8BJN4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc9Q8BJN4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc9Q8BJN4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc9Q8BJN4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc9Q8BJN4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc9Q8BJN4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc9Q8BJN4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc9Q8BJN4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc9Q8BJN4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc9Q8BJN4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc9Q8BJN4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc9Q8BJN4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc9Q8BJN4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc9Q8BJN4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc9Q8BJN4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc9Q8BJN4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc9Q8BJN4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc9Q8BJN4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms