Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rufy1Q8BIJ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rufy1Q8BIJ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rufy1Q8BIJ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rufy1Q8BIJ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rufy1Q8BIJ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rufy1Q8BIJ7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rufy1Q8BIJ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rufy1Q8BIJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rufy1Q8BIJ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rufy1Q8BIJ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rufy1Q8BIJ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rufy1Q8BIJ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rufy1Q8BIJ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rufy1Q8BIJ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rufy1Q8BIJ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rufy1Q8BIJ7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rufy1Q8BIJ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rufy1Q8BIJ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rufy1Q8BIJ7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy1Q8BIJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rufy1Q8BIJ7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rufy1Q8BIJ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy1Q8BIJ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy1Q8BIJ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy1Q8BIJ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rufy1Q8BIJ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rufy1Q8BIJ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rufy1Q8BIJ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rufy1Q8BIJ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rufy1Q8BIJ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rufy1Q8BIJ7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy1Q8BIJ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rufy1Q8BIJ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rufy1Q8BIJ7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rufy1Q8BIJ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy1Q8BIJ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy1Q8BIJ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy1Q8BIJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rufy1Q8BIJ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rufy1Q8BIJ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rufy1Q8BIJ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rufy1Q8BIJ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rufy1Q8BIJ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms