Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe23Q8BGW3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe23Q8BGW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe23Q8BGW3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms