Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q8BGC1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Q8BGC1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q8BGC1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q8BGC1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8BGC1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8BGC1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8BGC1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q8BGC1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8BGC1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q8BGC1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8BGC1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8BGC1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8BGC1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q8BGC1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q8BGC1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q8BGC1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8BGC1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8BGC1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8BGC1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8BGC1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q8BGC1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q8BGC1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8BGC1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8BGC1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Q8BGC1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8BGC1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8BGC1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8BGC1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q8BGC1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q8BGC1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q8BGC1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q8BGC1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Q8BGC1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q8BGC1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms