Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krr1Q8BGA5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krr1Q8BGA5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krr1Q8BGA5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krr1Q8BGA5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krr1Q8BGA5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krr1Q8BGA5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krr1Q8BGA5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krr1Q8BGA5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krr1Q8BGA5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krr1Q8BGA5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krr1Q8BGA5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krr1Q8BGA5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krr1Q8BGA5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krr1Q8BGA5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krr1Q8BGA5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms