Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pknox2Q8BG99 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pknox2Q8BG99 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pknox2Q8BG99 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pknox2Q8BG99 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pknox2Q8BG99 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pknox2Q8BG99 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pknox2Q8BG99 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pknox2Q8BG99 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pknox2Q8BG99 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pknox2Q8BG99 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pknox2Q8BG99 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pknox2Q8BG99 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pknox2Q8BG99 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pknox2Q8BG99 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pknox2Q8BG99 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pknox2Q8BG99 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pknox2Q8BG99 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pknox2Q8BG99 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pknox2Q8BG99 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pknox2Q8BG99 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pknox2Q8BG99 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pknox2Q8BG99 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pknox2Q8BG99 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pknox2Q8BG99 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pknox2Q8BG99 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pknox2Q8BG99 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pknox2Q8BG99 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pknox2Q8BG99 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pknox2Q8BG99 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pknox2Q8BG99 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pknox2Q8BG99 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pknox2Q8BG99 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pknox2Q8BG99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pknox2Q8BG99 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pknox2Q8BG99 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pknox2Q8BG99 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pknox2Q8BG99 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pknox2Q8BG99 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pknox2Q8BG99 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pknox2Q8BG99 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pknox2Q8BG99 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pknox2Q8BG99 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pknox2Q8BG99 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pknox2Q8BG99 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pknox2Q8BG99 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pknox2Q8BG99 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pknox2Q8BG99 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pknox2Q8BG99 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pknox2Q8BG99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pknox2Q8BG99 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pknox2Q8BG99 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pknox2Q8BG99 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pknox2Q8BG99 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pknox2Q8BG99 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pknox2Q8BG99 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pknox2Q8BG99 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pknox2Q8BG99 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms