Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Necab1Q8BG18 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Necab1Q8BG18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Necab1Q8BG18 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Necab1Q8BG18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Necab1Q8BG18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Necab1Q8BG18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Necab1Q8BG18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Necab1Q8BG18 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Necab1Q8BG18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Necab1Q8BG18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Necab1Q8BG18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Necab1Q8BG18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Necab1Q8BG18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Necab1Q8BG18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Necab1Q8BG18 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Necab1Q8BG18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Necab1Q8BG18 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Necab1Q8BG18 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Necab1Q8BG18 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Necab1Q8BG18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Necab1Q8BG18 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Necab1Q8BG18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Necab1Q8BG18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Necab1Q8BG18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Necab1Q8BG18 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Necab1Q8BG18 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Necab1Q8BG18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Necab1Q8BG18 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Necab1Q8BG18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms