Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc28Q80XJ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc28Q80XJ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc28Q80XJ3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc28Q80XJ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc28Q80XJ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc28Q80XJ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc28Q80XJ3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc28Q80XJ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc28Q80XJ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc28Q80XJ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc28Q80XJ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc28Q80XJ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc28Q80XJ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc28Q80XJ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc28Q80XJ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc28Q80XJ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc28Q80XJ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc28Q80XJ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc28Q80XJ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc28Q80XJ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc28Q80XJ3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc28Q80XJ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc28Q80XJ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc28Q80XJ3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc28Q80XJ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc28Q80XJ3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc28Q80XJ3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc28Q80XJ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc28Q80XJ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc28Q80XJ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc28Q80XJ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc28Q80XJ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc28Q80XJ3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc28Q80XJ3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc28Q80XJ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc28Q80XJ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc28Q80XJ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc28Q80XJ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc28Q80XJ3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc28Q80XJ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc28Q80XJ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc28Q80XJ3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc28Q80XJ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc28Q80XJ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc28Q80XJ3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc28Q80XJ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc28Q80XJ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc28Q80XJ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc28Q80XJ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc28Q80XJ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc28Q80XJ3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc28Q80XJ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms