Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnupnQ80W37 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SnupnQ80W37 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnupnQ80W37 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnupnQ80W37 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnupnQ80W37 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnupnQ80W37 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnupnQ80W37 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnupnQ80W37 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnupnQ80W37 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnupnQ80W37 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SnupnQ80W37 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnupnQ80W37 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnupnQ80W37 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnupnQ80W37 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnupnQ80W37 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnupnQ80W37 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnupnQ80W37 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SnupnQ80W37 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnupnQ80W37 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SnupnQ80W37 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SnupnQ80W37 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SnupnQ80W37 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnupnQ80W37 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SnupnQ80W37 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SnupnQ80W37 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SnupnQ80W37 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnupnQ80W37 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnupnQ80W37 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnupnQ80W37 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnupnQ80W37 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnupnQ80W37 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnupnQ80W37 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnupnQ80W37 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SnupnQ80W37 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnupnQ80W37 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnupnQ80W37 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnupnQ80W37 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnupnQ80W37 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnupnQ80W37 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SnupnQ80W37 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnupnQ80W37 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnupnQ80W37 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnupnQ80W37 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnupnQ80W37 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnupnQ80W37 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnupnQ80W37 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnupnQ80W37 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnupnQ80W37 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnupnQ80W37 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnupnQ80W37 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnupnQ80W37 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnupnQ80W37 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnupnQ80W37 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms