Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actr5Q80US4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actr5Q80US4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actr5Q80US4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actr5Q80US4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actr5Q80US4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actr5Q80US4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Actr5Q80US4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actr5Q80US4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actr5Q80US4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actr5Q80US4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actr5Q80US4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actr5Q80US4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actr5Q80US4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Actr5Q80US4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actr5Q80US4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actr5Q80US4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actr5Q80US4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actr5Q80US4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actr5Q80US4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms