Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SnphQ80U23 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SnphQ80U23 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SnphQ80U23 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SnphQ80U23 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms