Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SnphQ80U23 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SnphQ80U23 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SnphQ80U23 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SnphQ80U23 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SnphQ80U23 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SnphQ80U23 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SnphQ80U23 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnphQ80U23 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SnphQ80U23 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnphQ80U23 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnphQ80U23 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms