Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Cul9Q80TT8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cul9Q80TT8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cul9Q80TT8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cul9Q80TT8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cul9Q80TT8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Cul9Q80TT8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cul9Q80TT8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cul9Q80TT8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cul9Q80TT8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cul9Q80TT8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cul9Q80TT8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
Cul9Q80TT8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cul9Q80TT8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cul9Q80TT8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cul9Q80TT8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cul9Q80TT8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cul9Q80TT8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cul9Q80TT8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cul9Q80TT8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cul9Q80TT8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cul9Q80TT8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cul9Q80TT8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cul9Q80TT8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Cul9Q80TT8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Cul9Q80TT8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cul9Q80TT8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cul9Q80TT8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cul9Q80TT8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cul9Q80TT8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Cul9Q80TT8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Cul9Q80TT8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cul9Q80TT8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cul9Q80TT8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Cul9Q80TT8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cul9Q80TT8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cul9Q80TT8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Cul9Q80TT8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cul9Q80TT8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cul9Q80TT8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cul9Q80TT8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cul9Q80TT8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cul9Q80TT8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cul9Q80TT8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cul9Q80TT8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cul9Q80TT8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cul9Q80TT8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cul9Q80TT8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cul9Q80TT8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Cul9Q80TT8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cul9Q80TT8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cul9Q80TT8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cul9Q80TT8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cul9Q80TT8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Cul9Q80TT8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cul9Q80TT8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cul9Q80TT8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cul9Q80TT8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cul9Q80TT8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cul9Q80TT8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cul9Q80TT8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cul9Q80TT8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Cul9Q80TT8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Cul9Q80TT8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cul9Q80TT8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cul9Q80TT8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cul9Q80TT8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cul9Q80TT8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cul9Q80TT8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cul9Q80TT8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cul9Q80TT8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cul9Q80TT8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Cul9Q80TT8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Cul9Q80TT8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cul9Q80TT8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cul9Q80TT8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cul9Q80TT8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Cul9Q80TT8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Cul9Q80TT8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Cul9Q80TT8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Cul9Q80TT8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Cul9Q80TT8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cul9Q80TT8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cul9Q80TT8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cul9Q80TT8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Cul9Q80TT8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cul9Q80TT8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cul9Q80TT8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms