Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl29Q80T74 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl29Q80T74 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl29Q80T74 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl29Q80T74 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl29Q80T74 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl29Q80T74 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl29Q80T74 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl29Q80T74 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl29Q80T74 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl29Q80T74 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl29Q80T74 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl29Q80T74 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhl29Q80T74 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhl29Q80T74 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl29Q80T74 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl29Q80T74 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl29Q80T74 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl29Q80T74 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl29Q80T74 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl29Q80T74 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl29Q80T74 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl29Q80T74 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl29Q80T74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl29Q80T74 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhl29Q80T74 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhl29Q80T74 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhl29Q80T74 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl29Q80T74 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhl29Q80T74 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl29Q80T74 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl29Q80T74 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl29Q80T74 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl29Q80T74 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl29Q80T74 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl29Q80T74 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl29Q80T74 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl29Q80T74 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl29Q80T74 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms