Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Actn1Q7TPR4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Actn1Q7TPR4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Actn1Q7TPR4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Actn1Q7TPR4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Actn1Q7TPR4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Actn1Q7TPR4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Actn1Q7TPR4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Actn1Q7TPR4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Actn1Q7TPR4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Actn1Q7TPR4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Actn1Q7TPR4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Actn1Q7TPR4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Actn1Q7TPR4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Actn1Q7TPR4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Actn1Q7TPR4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Actn1Q7TPR4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Actn1Q7TPR4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Actn1Q7TPR4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Actn1Q7TPR4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Actn1Q7TPR4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Actn1Q7TPR4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Actn1Q7TPR4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Actn1Q7TPR4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Actn1Q7TPR4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Actn1Q7TPR4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Actn1Q7TPR4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Actn1Q7TPR4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Actn1Q7TPR4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Actn1Q7TPR4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Actn1Q7TPR4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Actn1Q7TPR4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Actn1Q7TPR4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Actn1Q7TPR4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Actn1Q7TPR4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Actn1Q7TPR4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Actn1Q7TPR4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Actn1Q7TPR4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Actn1Q7TPR4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Actn1Q7TPR4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Actn1Q7TPR4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Actn1Q7TPR4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Actn1Q7TPR4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Actn1Q7TPR4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Actn1Q7TPR4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Actn1Q7TPR4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Actn1Q7TPR4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Actn1Q7TPR4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Actn1Q7TPR4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Actn1Q7TPR4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Actn1Q7TPR4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Actn1Q7TPR4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Actn1Q7TPR4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms