Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim17Q7TPM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim17Q7TPM3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim17Q7TPM3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim17Q7TPM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim17Q7TPM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim17Q7TPM3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim17Q7TPM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim17Q7TPM3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim17Q7TPM3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim17Q7TPM3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim17Q7TPM3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim17Q7TPM3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim17Q7TPM3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim17Q7TPM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim17Q7TPM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim17Q7TPM3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim17Q7TPM3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim17Q7TPM3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim17Q7TPM3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim17Q7TPM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim17Q7TPM3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim17Q7TPM3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim17Q7TPM3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim17Q7TPM3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim17Q7TPM3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim17Q7TPM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim17Q7TPM3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim17Q7TPM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim17Q7TPM3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim17Q7TPM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim17Q7TPM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim17Q7TPM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim17Q7TPM3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim17Q7TPM3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim17Q7TPM3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim17Q7TPM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim17Q7TPM3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim17Q7TPM3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim17Q7TPM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim17Q7TPM3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim17Q7TPM3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim17Q7TPM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim17Q7TPM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim17Q7TPM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim17Q7TPM3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim17Q7TPM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim17Q7TPM3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms