Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx4Q7TNK1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rfx4Q7TNK1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx4Q7TNK1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx4Q7TNK1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx4Q7TNK1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx4Q7TNK1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx4Q7TNK1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx4Q7TNK1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx4Q7TNK1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfx4Q7TNK1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx4Q7TNK1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rfx4Q7TNK1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfx4Q7TNK1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx4Q7TNK1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx4Q7TNK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx4Q7TNK1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms