Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SyncripQ7TMK9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SyncripQ7TMK9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SyncripQ7TMK9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SyncripQ7TMK9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SyncripQ7TMK9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SyncripQ7TMK9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SyncripQ7TMK9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SyncripQ7TMK9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SyncripQ7TMK9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SyncripQ7TMK9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SyncripQ7TMK9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SyncripQ7TMK9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SyncripQ7TMK9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SyncripQ7TMK9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SyncripQ7TMK9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SyncripQ7TMK9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SyncripQ7TMK9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SyncripQ7TMK9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SyncripQ7TMK9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SyncripQ7TMK9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SyncripQ7TMK9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SyncripQ7TMK9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SyncripQ7TMK9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SyncripQ7TMK9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SyncripQ7TMK9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SyncripQ7TMK9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SyncripQ7TMK9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SyncripQ7TMK9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SyncripQ7TMK9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SyncripQ7TMK9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SyncripQ7TMK9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SyncripQ7TMK9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SyncripQ7TMK9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SyncripQ7TMK9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SyncripQ7TMK9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SyncripQ7TMK9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SyncripQ7TMK9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SyncripQ7TMK9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SyncripQ7TMK9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SyncripQ7TMK9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms