Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sys1Q78S06 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sys1Q78S06 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sys1Q78S06 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sys1Q78S06 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sys1Q78S06 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sys1Q78S06 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sys1Q78S06 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sys1Q78S06 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sys1Q78S06 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sys1Q78S06 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sys1Q78S06 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sys1Q78S06 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sys1Q78S06 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sys1Q78S06 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sys1Q78S06 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sys1Q78S06 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sys1Q78S06 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sys1Q78S06 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sys1Q78S06 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sys1Q78S06 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sys1Q78S06 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms