Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed3Q78IS1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed3Q78IS1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed3Q78IS1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed3Q78IS1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed3Q78IS1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed3Q78IS1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed3Q78IS1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed3Q78IS1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed3Q78IS1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed3Q78IS1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed3Q78IS1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed3Q78IS1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed3Q78IS1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed3Q78IS1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed3Q78IS1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms