Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cspg5Q71M36 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cspg5Q71M36 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cspg5Q71M36 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cspg5Q71M36 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cspg5Q71M36 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cspg5Q71M36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cspg5Q71M36 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cspg5Q71M36 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cspg5Q71M36 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cspg5Q71M36 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cspg5Q71M36 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cspg5Q71M36 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cspg5Q71M36 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cspg5Q71M36 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cspg5Q71M36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cspg5Q71M36 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cspg5Q71M36 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cspg5Q71M36 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cspg5Q71M36 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cspg5Q71M36 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cspg5Q71M36 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cspg5Q71M36 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cspg5Q71M36 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cspg5Q71M36 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cspg5Q71M36 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cspg5Q71M36 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cspg5Q71M36 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cspg5Q71M36 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cspg5Q71M36 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cspg5Q71M36 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cspg5Q71M36 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspg5Q71M36 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspg5Q71M36 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspg5Q71M36 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspg5Q71M36 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cspg5Q71M36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cspg5Q71M36 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cspg5Q71M36 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cspg5Q71M36 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cspg5Q71M36 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cspg5Q71M36 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cspg5Q71M36 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cspg5Q71M36 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cspg5Q71M36 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cspg5Q71M36 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cspg5Q71M36 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cspg5Q71M36 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cspg5Q71M36 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cspg5Q71M36 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cspg5Q71M36 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cspg5Q71M36 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cspg5Q71M36 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cspg5Q71M36 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cspg5Q71M36 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cspg5Q71M36 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cspg5Q71M36 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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