Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl35Q6ZWV7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl35Q6ZWV7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl35Q6ZWV7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl35Q6ZWV7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl35Q6ZWV7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl35Q6ZWV7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl35Q6ZWV7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl35Q6ZWV7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl35Q6ZWV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl35Q6ZWV7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl35Q6ZWV7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl35Q6ZWV7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl35Q6ZWV7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl35Q6ZWV7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl35Q6ZWV7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl35Q6ZWV7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl35Q6ZWV7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl35Q6ZWV7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl35Q6ZWV7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms