Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spcs3Q6ZWQ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spcs3Q6ZWQ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spcs3Q6ZWQ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spcs3Q6ZWQ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Spcs3Q6ZWQ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spcs3Q6ZWQ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spcs3Q6ZWQ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spcs3Q6ZWQ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spcs3Q6ZWQ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms