Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syne2Q6ZWQ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syne2Q6ZWQ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syne2Q6ZWQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syne2Q6ZWQ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms