Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RfflQ6ZQM0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RfflQ6ZQM0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RfflQ6ZQM0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RfflQ6ZQM0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RfflQ6ZQM0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RfflQ6ZQM0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RfflQ6ZQM0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RfflQ6ZQM0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RfflQ6ZQM0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RfflQ6ZQM0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RfflQ6ZQM0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RfflQ6ZQM0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RfflQ6ZQM0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms