Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ssxb10Q6XAR7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ssxb10Q6XAR7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssxb10Q6XAR7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ssxb10Q6XAR7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ssxb10Q6XAR7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ssxb10Q6XAR7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ssxb10Q6XAR7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ssxb10Q6XAR7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ssxb10Q6XAR7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ssxb10Q6XAR7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ssxb10Q6XAR7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ssxb10Q6XAR7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ssxb10Q6XAR7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ssxb10Q6XAR7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssxb10Q6XAR7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssxb10Q6XAR7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssxb10Q6XAR7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssxb10Q6XAR7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssxb10Q6XAR7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssxb10Q6XAR7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ssxb10Q6XAR7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ssxb10Q6XAR7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssxb10Q6XAR7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssxb10Q6XAR7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms