Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Casc1Q6TDU8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Casc1Q6TDU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Casc1Q6TDU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Casc1Q6TDU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Casc1Q6TDU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Casc1Q6TDU8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Casc1Q6TDU8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Casc1Q6TDU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Casc1Q6TDU8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Casc1Q6TDU8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Casc1Q6TDU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Casc1Q6TDU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Casc1Q6TDU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Casc1Q6TDU8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Casc1Q6TDU8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Casc1Q6TDU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Casc1Q6TDU8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Casc1Q6TDU8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Casc1Q6TDU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casc1Q6TDU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casc1Q6TDU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Casc1Q6TDU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Casc1Q6TDU8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Casc1Q6TDU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Casc1Q6TDU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Casc1Q6TDU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Casc1Q6TDU8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Casc1Q6TDU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Casc1Q6TDU8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Casc1Q6TDU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Casc1Q6TDU8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Casc1Q6TDU8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Casc1Q6TDU8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Casc1Q6TDU8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms