Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ld3Q6SJQ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd300ld3Q6SJQ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300ld3Q6SJQ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300ld3Q6SJQ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300ld3Q6SJQ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd300ld3Q6SJQ5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300ld3Q6SJQ5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300ld3Q6SJQ5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd300ld3Q6SJQ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms